Prije točno sto godina (1910. godine), don Luka Jelić je u crkvi sv. Križa uredio prvi muzejski postav pod nazivom 'Starinska zbirka'. U njoj su se uglavnom nalazili ulomci iz srednjovjekovnog razdoblja, dijelovi namještaja iz ninskih crkvi te brojni nadgrobni spomenici iz rimskog razdoblja, da bi se nakon 50 godina, obogaćena novom građom, zbirka preselila na današnju lokaciju. Krajem 1990-ih dodani su novi paviljoni, tako da muzej sada ima sedam prostorija gdje su obuhvaćena sva bitnija povijesna razdoblja vezana uz Nin.