Točno vrijeme izgradnje nije poznato, no pretpostavlja se da je crkva sv. Ivana Kanea nastala negdje krajem 13. stoljeća. Dugo vremena je bila zapuštena, točnije u razdoblju od 17. do 19. stoljeća, što je nažalost dovelo do urušavanja same crkve te uništenja freski u unutrašnjosti. Ipak, dio njih je djelomično sačuvan, pa ih možete vidjeti i danas. One su otkrivene u kupoli tijekom temeljite obnove crkve, u 60-im godinama 20. stoljeća.